Midten 1988 - 1992
I 1988 optog denne inkarnation af Death albummet Leprosy, hvorefter Rick Rozz endnu en gang blev fyret i 1989. James Murphy blev hyret til at erstatte Rozz, og gruppen indspillede albummet Spiritual Healing med ham i 1990. Schuldiner holdt med dette album op med at skrive om mord og vold, og begyndte at eksperimentere med mere politiske tekster. Gruppens stil begyndte også at ændre sig fra simpelt brutal death metal til en mere kompleks technical death metal, og melodi blev en mere vigtig del af gruppens numre. Senere i 1990 opløste Schuldiner gruppen igen, dog Andrews og Butler fortsatte en tourné under navnet Death med Walter Trachsler på guitar og Louie Carrisalez som forsanger, hvilket irreterede Schuldiner.
Herfeter opgav Chuck Schuldiner det at have en gruppe, og optog albummet Human med studiemusikkere Steve DiGiorgio, Sean Reinert og Paul Masvidal i 1991. Dette blev Deaths mest successfulde album, med mange priser og endda en del spilletid på MTV.
De sidste år 1993 - 2001
I 1993 forlod Reinert og Masvidal Death, for at være med i Cynic. Schuldiner hyrede så Gene Hoglan fra Dark Angel, et thrash metal band der for nylig var gået i opløsning. Til albummet Individual Thought Patterns blev Andy LaRocque fra gruppen King Diamond brugt som guitarist, men kunne ikke blive med gruppen på grund af hans obligationer til King Diamond. Schuldiner hyrede så Ralph Santolla som guitarist til den efterfølgende tourné. Til albummet Symbolic fra 1995, blev Santolla og DiGorgio dog erstattet af Kenny Conlon og Bobby Koeble, kendte musikere i Floridas death metal cirkler. Efter Symbolic skar Schuldiner sig af fra Roadrunner Records, og begyndte at skrive sange til gruppen Control Denied. Dette projekt blev dog ikke til noget, og Schuldiner genformede igen Death, denne gang med Richard Christy, Shannon Hamm og Scott Clanedenin, og The Sound of Preservance udkom på Nuclear Blast i 1998.